鉴定亲子关系目前用得最多的是DNA分型鉴定。人的血液、毛发、唾液、口腔细胞及骨头等都可以用于亲子鉴定，十分方便。
一个人有23对（46条）染色体，同一对染色体同一位置上的一对基因称为等位基因，一般一个来自父亲，一个来自母亲。如果检测到某个DNA位点的等位基因，一个与母亲相同，另一个就应与父亲相同，否则就存在疑问了。
利用DNA进行亲子鉴定，只要作十几至几十个DNA位点作检测，如果全部一样，就可以确定亲子关系，如果有3个以上的位点不同，则可排除亲子关系，有一两个位点不同，则应考虑基因突变的可能，加做一些位点的检测进行辨别。DNA亲子鉴定，否定亲子关系的准确率几近100%，肯定亲子关系的准确率可达到99.99%
不过DNA的亲子鉴定虽然准确，但是也有问题，那就是必须给需要夫妻双方配合才行，否则检验结果不够准确，也就是说你带着孩子偷偷摸摸去查，没用。这就有个问题了，这会不会影响到夫妻的关系呢？
比如我就听说过这样一件事，有个丈夫挺矮小的，老婆长得特漂亮，两个人这个儿子，长得那是高大威猛，后来还入选了学校的篮球队。这丈夫就犯嘀咕了！这孩子到底是不是自己的？
后来，就有人跟他说带着孩子去做个亲子鉴定，但是这个老婆一听就火了，你这是怀疑我的清白，这孩子就是你的！两口子为这事天天打架，婚姻几乎破裂。后来，这个妻子一赌气，就跟丈夫去做了这个亲子鉴定，没想到这个孩子就是这个矮个子丈夫的。