其次是战场形势的恶化。在天京事变前,随着在江西的胜利和攻破江北、江南两个大营,太平军已基本上掌握了战场的主动权。但天京事变的突然爆发,不仅使得太平军在各个战场转取守势,而且使得清军有了喘息乃至反扑的机会。其中形势最为危急的武汉两城,已被迫于1856年12月间弃守。
好在京外的太平军各部队,除少数为杨秀清族人或亲信的将领遭到杀害外,基本未在事变中遭受损失。甚至杨秀清的兄弟行中,杨辅清因领兵在外也幸免于难。后来在追究天京屠杀事件的罪魁祸首时,更未株连韦、秦、陈三人的族人。因此在石达开主政时,还不是“外无用将”,而是“外有用将”,这就为石达开扭转战场局势提供了良好的基础。
最为严峻的还是思想上的混乱和人心的涣散。杨秀清在世时,每以“天父无所不在,无所不知,无所不能”以及“天父看顾”、“天父作主”、“天父担当”等等,激励广大太平军将士放胆诛妖,勇往直前地为太平天国事业的胜利而奋斗。
但在天京城内的大变乱中,有着代天父传言莫大权力的杨秀清,不仅自己的性命不保,甚至连其家人和部属也都未能“看顾”。他们的悲惨结局,表明上帝权能无边神话的破灭,使人们失去了精神上维系的力量。