宋代统治者对道学情有独钟，宋真宗时还加封老子为“太上老君”，宋徽宗时把《老子》列为太学以及各地方学校的课本上都必须专门讲授《老子》，就在统治者大力推崇《老子》的同时，《老子》的一些思想也渗透到理学之中。
秦九韶幼时就对道学感兴趣，其父在对他的教育方面也是循循善诱，顺其自然，任其发展，既不压抑特长，也不赶鸭子上架。而秦九韶的师傅魏了翁，师承了朱熹学派的理学思想，后又受陆九渊学说影响，自成一家。这些都让秦九韶受益匪浅。
后来，秦九韶受教于“隐君子”陈元靓，陈元靓是博学多才的学者，秦九韶在对中国传统数学有深入研究的陈元靓的指导和帮助下，潜心研读了许多古算书，特别是《九章算术》，这一点从其《数学九章》中留下了《九章算术》深深的足迹和影子很容易看出。
另外，秦九韶也推崇宋初的道人陈抟，陈抟以传统的道家思想为核心，参考儒家学说，奠定了宋代更深的基础，是理学的先驱。秦九韶对陈抟的道学思想主张有很高的评价，他还曾向对两宋理学有很深研究的陈振孙推介陈抟的身世、宗教思想等。