陈公博出走日本,最主要的原因自然是想逃避逮捕与审判。但直接促成的还有几个因素:一个是他感到了自己的安全受到威胁,这个威胁尚不是远在重庆的蒋介石,而是近在咫尺的周佛海。当日寇宣布投降后,周佛海手下人趁机抢占地盘,南京城内一片混乱;而重庆方面又委托了周佛海为军委会上海行动总队指挥,接着任命了任援道为南京先遣军司令。显然,陈公博的地位完全被周佛海等人取而代之了。陈公博一伙深恐周佛海将他们一网打尽,向重庆邀功,所以其主要追随者全部与陈东逃日本。
第二个因素是当时南京城内有人传言陈公博拥兵自重,如他留在南京,可以指挥部队抵抗蒋军,而追随他的军校学生在击退了周佛海一派的袭扰后,却不肯撤退,这更使陈公博有了拥兵自重之嫌。陈公博怕引起蒋介石猜疑,只有离开南京。