朝中与东林、复社作对的主要是温体仁。《明史·奸臣传·温体仁传》记载：
温体仁，字长卿，乌程人，万历二十六年进士。累官礼部侍郎。崇祯初迁尚书，协理詹士府事。为人外谨而中猛鸷，机深刺骨。[1]
老温天启时曾经巴结、逢迎阉党，崇祯时，魏忠贤遗党一心盼望着他能够“翻逆案，攻东林”。因此老温成了复社人士极力反对的人物。张溥暗中收集了温体仁交集宦官、结党营私、援引同乡等等违背朝廷法度的劣行，写成疏稿，交吴伟业叫他上奏。因为吴伟业毕竟是朝廷七品命官，而张溥只是翰林院实习官品轶不入流无资格上书。但吴伟业对朝局尚不熟悉，以一名刚刚上任的小小编修骤然参奏次辅，内心不免胆怯，未敢贸然行事。当时老温一党中为其“主持门户，操控线索”的是大理寺少卿蔡亦琛。吴伟业难违师命，于是将弹劾老温的奏章，改头换面，变成了弹劾蔡亦琛的奏章，参了蔡一本。结果还是惹得温体仁大怒，欲重重处置吴伟业和张溥。首辅周延儒曲意为吴、张回护开脱，才得以无事。（见陆世仪《复社纪略》）从此，吴伟业便被视为复社在朝廷中的代表人物，成为老温一党的死对头，这样从崇祯朝一直延续到弘光朝被挟裹在党争的旋涡中难以解脱。[2]